Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RCSD1Q6JBY9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms