Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VIRMAQ69YN4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VIRMAQ69YN4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms