Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LRCH2Q5VUJ6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms