Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT03

NUTM2D, NUT family member 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUTM2DQ5VT03 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NUTM2DQ5VT03 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NUTM2DQ5VT03 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NUTM2DQ5VT03 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUTM2DQ5VT03 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NUTM2DQ5VT03 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NUTM2DQ5VT03 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms