Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
OBSCNQ5VST9 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms