Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTC39AQ5SRH9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms