Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPL39P5Q59GN2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms