Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf46Q504U0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf46Q504U0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms