Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTXN3Q4LDR2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTXN3Q4LDR2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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