Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TBRG1Q3YBR2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms