Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL40Q2TBA0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL40Q2TBA0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms