Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGSM1Q2NKQ1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGSM1Q2NKQ1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms