Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Q1T7F1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Q1T7F1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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