Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IMPG1Q17R60 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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