Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HADHQ16836 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HADHQ16836 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HADHQ16836 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HADHQ16836 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HADHQ16836 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HADHQ16836 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HADHQ16836 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HADHQ16836 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HADHQ16836 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HADHQ16836 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HADHQ16836 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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