Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPP1Q16831 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms