Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RTN1Q16799 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN1Q16799 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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