Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LAMA3Q16787 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LAMA3Q16787 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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