Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CLPPQ16740 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CLPPQ16740 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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