Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNCBQ16143 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms