Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK4Q16099 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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