Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHRNA6Q15825 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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