Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEBPEQ15744 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CEBPEQ15744 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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