Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDK1Q15118 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDK1Q15118 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms