Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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BRD3Q15059 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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BRD3Q15059 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BRD3Q15059 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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BRD3Q15059 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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BRD3Q15059 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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BRD3Q15059 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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BRD3Q15059 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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BRD3Q15059 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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BRD3Q15059 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRD3Q15059 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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