Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNIP1Q15025 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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