Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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COL9A2Q14055 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL9A2Q14055 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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