Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PDE6HQ13956 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PDE6HQ13956 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PDE6HQ13956 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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