Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
APOFQ13790 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOFQ13790 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOFQ13790 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOFQ13790 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOFQ13790 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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