Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NCOA4Q13772 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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