Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CUL3Q13618 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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