Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PEX6Q13608 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PEX6Q13608 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms