Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NEUROD1Q13562 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NEUROD1Q13562 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
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