Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
IKZF1Q13422 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IKZF1Q13422 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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