Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SKP2Q13309 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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SKP2Q13309 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SKP2Q13309 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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