Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RIGQ13278 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RIGQ13278 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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