Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRSF6Q13247 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRSF6Q13247 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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