Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NME3Q13232 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NME3Q13232 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME3Q13232 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME3Q13232 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME3Q13232 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME3Q13232 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NME3Q13232 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NME3Q13232 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NME3Q13232 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms