Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GRIN2BQ13224 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GRIN2BQ13224 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
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