Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHAF1BQ13112 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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