Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms