Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FOXF1Q12946 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXF1Q12946 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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