Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COX10Q12887 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX10Q12887 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX10Q12887 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX10Q12887 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX10Q12887 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX10Q12887 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX10Q12887 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COX10Q12887 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX10Q12887 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COX10Q12887 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms