Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STX4Q12846 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STX4Q12846 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms