Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMOD3Q0VAK6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMOD3Q0VAK6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms