Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms