Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LOXL1Q08397 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms