Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms