Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNG1Q06432 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNG1Q06432 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms