Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXOSC9Q06265 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC9Q06265 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms